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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

让城市治理变“智”理 浪潮助推智慧城市建设******

　　一网通办、智慧医疗、智慧交通……智慧城市建设是提升城市能级与核心竞争力的重要载体。作为新一代信息技术产业领军企业，浪潮牵头制定了全球首个智慧城市运营国际标准，并蝉联国际数据集团（IDC）中国领军智慧城市服务商。目前，浪潮智慧城市已经在重庆、济南、石家庄、郑东新区等全国60多个城市落地运行，树立了众多业界标杆。

　　近年来，各地政府纷纷加快智慧城市建设步伐。根据中国智慧城市工作委员会预测，2022年我国智慧城市市场规模达到25万亿元。如何提高城市应对危机的能力，如何打造更加智慧化的城市，成为新型智慧城市建设需要考虑的问题。

　　浪潮深耕智慧城市多年，在城市治理、应急管理、公共交通、生态环保、基层治理、城市服务等方面提供综合应用能力，通过对城市全域运行数据进行实时汇聚、监测、治理和分析，全面感知城市生命体征，辅助宏观决策指挥，预测预警重大事件，配置优化公共资源，保障城市安全有序运行，支撑政府、社会、经济数字化转型。

　　在智慧城市建设中，浪潮以大数据中心、城市杆柱、城市静态交通等新型基础设施，为人民绿色出行、低碳发展打牢基础；以城市大脑为核心的城市治理应用，全面提升城市宜居、宜业、宜行程度，提高人民的幸福感和满意度；以数据的长效持续运营，为经济社会数字化转型注入源源不断的动能，最终造福于民众。

　　如浪潮助力郑东新区以“1+1+N”的总体架构，打造“感知、联接、计算、应用”四位一体的“城市大脑”，汇聚了1137个5G基站数据、26万城市公共部件信息，同时接入292个停车场数据、105个微型环境监测站等各局（办）数据，城市更加“耳聪目明”。如今，小区内，电动车上电梯会被语音警示和拒载；街道上，感知设备能智能识别占道经营、乱堆物堆料、机动车违停等11种城市管理领域违法行为……“城市大脑”基于全时全域、互联互通的城市物联感知体系，形成了事件“发现-上报-流转-处置-评估”的基层治理闭环处置新模式，实现了信息早掌握，线索早排查、问题早发现、矛盾早化解、治安早防范，切实增强了人民群众的获得感、幸福感、安全感。

　　未来，浪潮将以“优政、惠民、兴业”为目标，围绕政务服务、城市安全、城市治理、经济发展和民生服务等领域，打造浪潮城市大脑，依托城市运行管理平台，形成“四网协同”的业务协同联动、城市运营管理体系，提高城市治理科学化精细化智能化水平，推进城市治理体系和治理能力现代化，使城市“善感知、有温度、会呼吸”。（柯岩）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）